生物固氮,玉米“腸道菌”送驚喜
與人類微生物組類似,植物微生物組被稱為植物的第二個基因組,對植物生長發(fā)育、養(yǎng)分吸收、病蟲害抵御等至關(guān)重要。
近日,科學(xué)家發(fā)現(xiàn)了定殖于玉米莖木質(zhì)部傷流液內(nèi)具有固氮能力且高度保守的核心細(xì)菌微生物組,它們?yōu)橛衩滋峁┝说貭I養(yǎng)并促進(jìn)根系生長。相關(guān)研究成果由中國農(nóng)科院農(nóng)業(yè)資源與農(nóng)業(yè)區(qū)劃研究所(以下簡稱資劃所)植物營養(yǎng)團(tuán)隊完成,并發(fā)表于《自然—通訊》。
被忽視的玉米“腸道”微生物組
植物體內(nèi)的微生物組是指生活在植物各部位(如葉、根或莖)內(nèi)部的微生物的集合及其與宿主之間的相互作用。
“近年來,大量研究開始關(guān)注植物微生物群落的結(jié)構(gòu)與功能,但主要關(guān)注植物的根際和葉際這兩個部位——這是植物與外界環(huán)境(包括微生物)相互作用的兩個關(guān)鍵界面——而忽視了植物的其他部位?!闭撐耐ㄓ嵶髡?、資劃所副研究員艾超告訴《中國科學(xué)報》,植物莖木質(zhì)部導(dǎo)管是一個有效的長距離運輸系統(tǒng),由根和莖之間的靜水壓力梯度驅(qū)動。這種驅(qū)動力確保了植物所需的水分、養(yǎng)分等物質(zhì)在不同器官之間的順利運輸。
也就是說,相對于植物的其他部位,植物莖木質(zhì)部導(dǎo)管的這種傳導(dǎo)特性使其形成了一個高度動態(tài)的內(nèi)部環(huán)境,成為連接植物地上和地下的關(guān)鍵“通道”。少量研究報道了植物根系選擇性招募的小部分細(xì)菌可以通過莖木質(zhì)部內(nèi)液體的流動擴(kuò)散到地上部植物器官。
而艾超等人所關(guān)注的木質(zhì)部傷流液,主要是指木質(zhì)部的汁液因根壓作用從導(dǎo)管中向地上部不斷移動而流出的部分。
他們根據(jù)此前的研究結(jié)論提出了這樣一個研究假設(shè):類似于人體腸道微生物組一樣,植物莖木質(zhì)部微生物組可能在植物生長發(fā)育中發(fā)揮著重要作用。
定位玉米“腸道”功能菌
國外研究發(fā)現(xiàn),墨西哥哈瓦卡地區(qū)貧瘠土壤中生長的玉米,其氣生根黏液富含固氮菌。這些固氮菌從空氣中捕捉到的氮能為玉米提供29%~82%的氮營養(yǎng)。
那么,玉米的“腸道”——木質(zhì)部導(dǎo)管中會不會也存在著固氮微生物?
論文第一作者、資劃所博士研究生張儷予介紹,固氮菌是能進(jìn)行生物固氮的各種原核生物的通稱,一般情況下它可分為三大類——自生固氮菌、共生固氮菌和聯(lián)合固氮菌。
自生固氮菌指各種自由生活、能獨立固定大氣氮的原核生物,一般固氮能力較弱。
共生固氮菌指必須與其他生物共生時才能固氮的原核微生物。例如,根瘤菌屬與豆科植物共生,形成根瘤共生體固氮;弗蘭克氏菌屬放線菌與非豆科植物共生,形成根瘤共生體固氮。
而聯(lián)合固氮菌在植物根表或根皮層內(nèi)生活,它并不形成根瘤,但也有較強(qiáng)的寄主專一性,固氮效率比自生固氮菌高。
“根瘤菌—豆科植物固氮得到了廣泛關(guān)注,非豆科植物,如甘蔗、玉米等作物與固氮菌的聯(lián)合固氮作用也得到了證實。未來如何充分利用生物固氮改善非豆科植物氮營養(yǎng),從而減少氮肥施用,一直是科學(xué)研究的前沿?zé)狳c?!卑f。
他們發(fā)現(xiàn),相對于非根際土壤、植物根系等其他植物部位,玉米莖木質(zhì)部傷流液選擇性地招募了以γ—變形菌綱為主的高度保守的核心微生物群落,其中含有部分高效固氮和協(xié)助固氮菌。其群落結(jié)構(gòu)幾乎不隨地理距離和環(huán)境距離變化。
研究人員通過豐度—占有模型確定了木質(zhì)部內(nèi)的25個核心微生物群落。它代表了在不同地點、不同施肥制度以及玉米基因型下可以穩(wěn)定存在的一組微生物類群。
未開發(fā)的微生物資源
為了驗證這些核心微生物群落在玉米生長發(fā)育中的作用,研究人員首先構(gòu)建了由兩個核心固氮菌和兩個輔助菌組成的合成群落。
他們利用驗證試驗證實了合成群落在植物體內(nèi)的定殖特征,又通過15N同位素稀釋方法證明了合成群落的生物固氮能力。
“玉米生長65天后,合成群落為玉米莖貢獻(xiàn)了11.8%的總氮?!卑f,不僅如此,合成群落還增加了玉米根系生物量。
根據(jù)全基因組測序結(jié)果,合成群落具有吲哚—3—乙酸(IAA)、乙烯等合成代謝途徑,這些生長激素可能對植物根系生長起到非常關(guān)鍵的作用。接種合成群落后,玉米根系生物量增加了13%。
“核心內(nèi)生菌與玉米宿主之間存在多機(jī)制的相互作用關(guān)系?!卑瑥?qiáng)調(diào),這些被忽視的植物“腸道”功能菌代表著一類未開發(fā)的微生物資源,可能在作物固氮促生方面發(fā)揮關(guān)鍵作用。
而且,研究證明,玉米“腸道”的核心功能菌在不同環(huán)境條件、不同玉米基因型下普適性存在,預(yù)示其在玉米的生長過程中可能扮演著更為重要的角色。
“令我們驚喜的是,基因組數(shù)據(jù)顯示,核心菌株中可能存在未被發(fā)現(xiàn)的細(xì)菌新種,我們會對這一結(jié)果做進(jìn)一步驗證?!卑f。
資劃所周衛(wèi)院士團(tuán)隊長期從事養(yǎng)分資源高效利用研究,該項研究通過評估不同土壤類型、氣候區(qū)和基因型的玉米微生物組的組裝機(jī)制和功能,證實了莖木質(zhì)部微生物組的固氮和促生功能,對今后植物促生菌研究和微生物肥料研發(fā)具有重要借鑒意義和參考價值。(李晨)
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