科研人員初步建立青藏高原水生微生物基因組和基因目錄
中新社武漢2月21日電 (馬芙蓉 孫慧)中國科研人員搜集來自青藏高原濕地、淡水湖、鹽水湖、河流、溫泉和冰川等六種水生生態(tài)系統(tǒng)的498個(gè)水體環(huán)境DNA樣本,并進(jìn)行宏基因組測序,初步建立了青藏高原水生微生物基因組和基因目錄。相關(guān)成果于近日發(fā)表在國際學(xué)術(shù)期刊《自然-通訊》。
這項(xiàng)工作由中國科學(xué)院水生生物研究所研究員繆煒與華中科技大學(xué)團(tuán)隊(duì)合作完成。繆煒21日受訪時(shí)表示,上述基因組和基因目錄作為高海拔水生微生物資源的重要資源庫,蘊(yùn)藏著發(fā)現(xiàn)新的微生物譜系和功能的潛力,有助于拓展對全球微生物物種、遺傳和功能多樣性的認(rèn)識。
青藏高原是世界海拔最高的高原,獨(dú)特地形特征使其成為眾多河流的主要源頭,被譽(yù)為“亞洲水塔”。其類型多樣的水生態(tài)系統(tǒng),孕育著豐富的水生微生物。
研究團(tuán)隊(duì)耗時(shí)4年,初步建立了青藏高原水生微生物基因組和基因目錄(Tibetan Plateau Microbial Catalog,簡稱“TPMC”)??姛樈榻B,TPMC目前包含3萬多個(gè)中高質(zhì)量的原核微生物(細(xì)菌和古菌)宏基因組組裝的基因組,聚類為1萬多個(gè)物種,其中88%為未注釋物種。此外,包含近3億個(gè)非冗余基因,其中15%為新基因;7萬多個(gè)生物合成基因簇,50%為新基因簇。
利用這些數(shù)據(jù),研究團(tuán)隊(duì)分析發(fā)現(xiàn),青藏高原微生物組的微生物組成相似性和共有基因數(shù)量,隨著距離和海拔的差異增大而下降?!斑@一微生物的傳播模式提示青藏高原可能不僅扮演著‘水塔’的角色,還具有‘微生物塔’的作用?!笨姛樥f。
繆煒表示,此項(xiàng)研究是中國科學(xué)院水生生物研究所牽頭發(fā)起的“萬種原生生物基因組計(jì)劃”進(jìn)展之一。相關(guān)原核微生物基因組目錄已發(fā)布于國家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心。(完)
版權(quán)聲明:凡注明“來源:中國西藏網(wǎng)”或“中國西藏網(wǎng)文”的所有作品,版權(quán)歸高原(北京)文化傳播有限公司。任何媒體轉(zhuǎn)載、摘編、引用,須注明來源中國西藏網(wǎng)和署著作者名,否則將追究相關(guān)法律責(zé)任。
- 讓基層干部少一些“為難”!省級大員密集部署
- 新版巡視工作條例公布!加強(qiáng)對“一把手”監(jiān)督
- 港大醫(yī)學(xué)院:新一年將繼續(xù)“搶人才”
- 粟斌:加強(qiáng)新就業(yè)形態(tài)勞動者權(quán)益維護(hù)
- 【履職一年間】全國人大代表董宏濤:設(shè)督導(dǎo)機(jī)制 促新時(shí)代產(chǎn)業(yè)工人成長成才
- 中國檢察機(jī)關(guān)將強(qiáng)化追繳和糾正行賄所獲不正當(dāng)利益
- 夫妻離婚要分孩子的26萬壓歲錢 咋判?法院這么說
- 最高檢:監(jiān)督“紙面服刑”防止該減刑不減刑
- “雙減”背景下,寒假作業(yè)不該成為學(xué)生的困擾
- 年輕人流行“搞副業(yè)”點(diǎn)燃不一樣的煙火氣